2052年，人类科技水平飞速发展，人类加强了对遥远星空的探索。 但在不断探索的过程当中，人类遇到了比他们强大得多的文明，一群自称为塞壬的文明物种侵略了人类的母星。 塞壬文明通过一种名为心智魔方的科技产物，开始大肆制造一种名为舰娘的高科技武器。她们诞生于二战时期的军舰意志，但在塞壬手中，她们大多数却如同提线木偶般，没有任何的思考能力。 舰娘的出现，弥补了塞壬在数量上的劣势，使得原本就处境艰难的人类更是雪上加霜。 短短一周的时间，太平洋，大西洋，印度洋和北冰洋就相继失守。人类不得已开始将人口向内陆迁移。 2054年1月1日。本应欢度新春的人们无奈踏上了离家的道路。走向了那黑暗又未知的前路。 随着人类对塞壬文明的不断接触，人们发现这个文明中的生物无法离开海水太长时间。这也是为什么明明拥有着巨大的科技差，人类却还是没有灭亡。这也使得内陆成为了人类最后一块生存地区。 但内陆无疑也成为了人类最后的囚笼，海面上强大的干扰装置使得人类任何型号的导弹都无法做到定位打击，而三人科技强大的拦截系统，也使得饱和打击成了笑话 就在人类陷入绝望之时，人类中，新生儿也出现了巨大的变化，相比普通人类，他们的大脑发育更加完全且身体恢复机能非常强悍，这使得只要拥有足够的教育资源，便可以使他们迅速的成长起来。科学家们试图通过研究来控制这种变异，但他们却在这些新生儿的基因当中发现了与赛壬相似的成分。 就在人类对此感到恐慌之时。大批舰娘开始越过海面，冲向了人类最后的生存地区。 2065年6月23日。舰娘开始对人类最后的城市“黎明”发起了进攻。人类也明白了塞壬久久没有行动的原因就是在集结这只可以登上内陆的舰娘部队。 2065年7月12日。“黎明”外围城区开始被舰娘占领。人类开启了最后的能量护罩，龟缩在了内城区。 2065年8月3日。在人类高层的领导下，人类实行了“火种”计划。万余名新生儿被转移到了早已建造好的地下城区，并将其冷冻降低生命特征...

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